En los ecosistemas terrestres la estratificación está definida por la altura de la vegetación:
En los ecosistemas acuáticos la estratificación está definida por la penetración de la luz (distintas cantidades de luz en el ambiente). En la zona fótica (hasta los 200m) viven seres fotosintetizadores y en la afótica heterótrofos y quimiosintéticos.
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